《意见》提出对自贸港重点园区专项编制实施水安全保障方案，建立园区管理机构与周边市县政府等共同参加的水务协商合作机制，着力以水系空间引领优化园区城镇空间布局。此外，要在园区建设中集中应用海绵城市、综合管廊等技术理念，统筹加强园区防洪排涝和雨水滞渗调蓄设施建设，增强园区洪涝灾害防治能力和韧性。推进园区高品质饮用水建设，对标国际国内先进水平，建立健全高品质饮用水技术标准体系，逐步实现园区生活饮用水全面达到可直饮标准。
《意见》还提出，发挥当地水生态环境优势，科学布局园区水系空间与保护修复，增强水体连通性，打造国际一流的生态宜居园区。加强园区的水资源节约集约循环利用，推动率先在园区形成节水型生产生活方式，提高再生水利用比例，不断提高用水效率和效益。沿海园区工业用水，可优先使用海水或海水淡化水。
在园区建设专业高效的生活污水处理系统，推进园区污水收集处理及污泥处理设施建设，改造和修复破损老旧污水管网，实行雨污分流。按照智慧海南建设总体要求，同步规划建设完善智慧水务平台，提升园区水务精细化管理水平。加快推进落实园区水资源论证、水土保持评估、节水评价等区域评估工作，将涉水行政许可和供水排水报装服务事项统一入驻政务服务大厅，优化提高服务质量和效率。
